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gProfiler 的 gmt 文件:Linux/R

发布时间:2022-07-24 01:46:33 196
# 数据

我正在为 gProfiler(custom, non-model plant) 准备背景 gmt 文件,但我拥有的是第一列的 Gene id,它需要以相反的顺序排列。Linux 或 R 中有没有办法重新排列这些数据?

**current**
Gene1   GO:A    GO:B    GO:C    GO:D    GO:E
Gene2   GO:E    GO:F    GO:G    GO:H    GO:I    GO:J
Gene3   GO:A    GO:D    GO:E    GO:H    GO:J
Gene4   GO:B    GO:C    GO:E    GO:F    GO:1J   
Gene5   GO:C    GO:J
**new**
GO:A    Gene1   Gene3
GO:B    Gene1   Gene4
GO:C    Gene1   Gene4   Gene5
GO:D    Gene1   Gene3
GO:E    Gene1   Gene2   Gene3   Gene4
GO:F    Gene2   Gene4
GO:G    Gene2
GO:H    Gene2   Gene3
GO:I    Gene2
GO:J    Gene2   Gene3   Gene4   Gene5
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